התכנית הבינלאומית במרכז מלטון לתואר שני בחינוך יהודי מיועדת בעיקר לסטודנטים המתגוררים מחוץ לישראל. הלימודים מתמחים בהבנה של החיים היהודיים בתפוצות ובהצעת פתרונות לאתגרים העומדים בפני החינוך היהודי בקהילות בחו"ל כיום. התוכנית הבינלאומית נעה לכיוונים חדשים ולהסתגלות למציאות המשתנה. הלימודים מתקיימים ברובם באופן מקוון, בשילוב של הוראה סינכרונית וא-סינכרונית. כמו כן, התכנית כוללת סמינר קיץ שמתקיים באוניברסיטה העברית בירושלים פעם בשנה. הקורסים משלבים שיעורים מוקלטים, פורומים אינטראקטיביים ומטלות שעוצבו מראש לאפשר למידה מרחוק מיטבית.
ניתן להצטרף לתכנית הבינלאומית באחד משני המסלולים: המסלול הבינלאומי באנגלית והמסלול הבינלאומי בספרדית ופורטוגזית.
